Protein–RNA interactions for Protein: P39925

AFG3, Mitochondrial respiratory chain complexes assembly protein AFG3, yeastyeast

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AFG3P39925 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.6□□□□□ -0.23
AFG3P39925 YEL076CYEL076C 651 nt13.6□□□□□ -0.23
AFG3P39925 FIS1YIL065C 468 nt13.6□□□□□ -0.23
AFG3P39925 YLR464WYLR464W 651 nt13.6□□□□□ -0.23
AFG3P39925 FUN26YAL022C 1554 nt13.59□□□□□ -0.23
AFG3P39925 LPX1YOR084W 1164 nt13.58□□□□□ -0.24
AFG3P39925 RTG1YOL067C 534 nt13.53□□□□□ -0.24
AFG3P39925 PHO4YFR034C 939 nt13.52□□□□□ -0.25
AFG3P39925 CCT6YDR188W 1641 nt13.48□□□□□ -0.25
AFG3P39925 ERV46YAL042W 1248 nt13.46□□□□□ -0.25
AFG3P39925 SIS1YNL007C 1059 nt13.43□□□□□ -0.26
AFG3P39925 YJL152WYJL152W 360 nt13.39□□□□□ -0.27
AFG3P39925 YDR433WYDR433W 441 nt13.33□□□□□ -0.28
AFG3P39925 IDH1YNL037C 1083 nt13.31□□□□□ -0.28
AFG3P39925 YKR040CYKR040C 504 nt13.28□□□□□ -0.28
AFG3P39925 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.27□□□□□ -0.29
AFG3P39925 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.27□□□□□ -0.29
AFG3P39925 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.26□□□□□ -0.29
AFG3P39925 YDR094WYDR094W 336 nt13.25□□□□□ -0.29
AFG3P39925 ALF1YNL148C 765 nt13.23□□□□□ -0.29
AFG3P39925 MXR2YCL033C 507 nt13.22□□□□□ -0.29
AFG3P39925 HUA1YGR268C 597 nt13.19□□□□□ -0.3
AFG3P39925 GBP2YCL011C 1284 nt13.15□□□□□ -0.3
AFG3P39925 YPS1YLR120C 1710 nt13.1□□□□□ -0.31
AFG3P39925 TIR4YOR009W 1464 nt13.1□□□□□ -0.31
AFG3P39925 YDR095CYDR095C 411 nt13.04□□□□□ -0.32
AFG3P39925 SBA1YKL117W 651 nt12.96□□□□□ -0.33
AFG3P39925 CAC2YML102W 1407 nt12.92□□□□□ -0.34
AFG3P39925 FRD1YEL047C 1413 nt12.9□□□□□ -0.34
AFG3P39925 TCD2YKL027W 1344 nt12.89□□□□□ -0.35
AFG3P39925 PTH1YHR189W 573 nt12.88□□□□□ -0.35
AFG3P39925 YMR057CYMR057C 372 nt12.88□□□□□ -0.35
AFG3P39925 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.86□□□□□ -0.35
AFG3P39925 ART5YGR068C 1761 nt12.84□□□□□ -0.35
AFG3P39925 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.84□□□□□ -0.35
AFG3P39925 DED1YOR204W 1815 nt12.83□□□□□ -0.36
AFG3P39925 YKL030WYKL030W 606 nt12.79□□□□□ -0.36
AFG3P39925 RPP2AYOL039W 321 nt12.79□□□□□ -0.36
AFG3P39925 PAU16YKL224C 372 nt12.77□□□□□ -0.37
AFG3P39925 PET9YBL030C 957 nt12.75□□□□□ -0.37
AFG3P39925 RRD1YIL153W 1182 nt12.74□□□□□ -0.37
AFG3P39925 PTP1YDL230W 1008 nt12.73□□□□□ -0.37
AFG3P39925 GFD2YCL036W 1701 nt12.72□□□□□ -0.37
AFG3P39925 LCB1YMR296C 1677 nt12.72□□□□□ -0.37
AFG3P39925 YLR235CYLR235C 399 nt12.71□□□□□ -0.37
AFG3P39925 SPT5YML010W 3192 nt12.67□□□□□ -0.38
AFG3P39925 FMT1YBL013W 1206 nt12.66□□□□□ -0.38
AFG3P39925 YCL042WYCL042W 360 nt12.66□□□□□ -0.38
AFG3P39925 PRE6YOL038W 765 nt12.64□□□□□ -0.39
AFG3P39925 SOR2YDL246C 1074 nt12.62□□□□□ -0.39
AFG3P39925 YFR018CYFR018C 1092 nt12.62□□□□□ -0.39
AFG3P39925 SOR1YJR159W 1074 nt12.62□□□□□ -0.39
AFG3P39925 FPS1YLL043W 2010 nt12.61□□□□□ -0.39
AFG3P39925 RRT5YFR032C 870 nt12.58□□□□□ -0.4
AFG3P39925 RTS2YOR077W 699 nt12.51□□□□□ -0.41
AFG3P39925 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.5□□□□□ -0.41
AFG3P39925 MEP2YNL142W 1500 nt12.47□□□□□ -0.41
AFG3P39925 SNF6YHL025W 999 nt12.45□□□□□ -0.42
AFG3P39925 TIM23YNR017W 669 nt12.44□□□□□ -0.42
AFG3P39925 CWP1YKL096W 720 nt12.43□□□□□ -0.42
AFG3P39925 DIC1YLR348C 897 nt12.41□□□□□ -0.42
AFG3P39925 ADH2YMR303C 1047 nt12.39□□□□□ -0.43
AFG3P39925 DCW1YKL046C 1350 nt12.37□□□□□ -0.43
AFG3P39925 FMP52YER004W 696 nt12.35□□□□□ -0.43
AFG3P39925 SSA4YER103W 1929 nt12.35□□□□□ -0.43
AFG3P39925 YFL066CYFL066C 1179 nt12.34□□□□□ -0.43
AFG3P39925 YLR179CYLR179C 606 nt12.34□□□□□ -0.43
AFG3P39925 CUE1YMR264W 612 nt12.32□□□□□ -0.44
AFG3P39925 IRC15YPL017C 1500 nt12.32□□□□□ -0.44
AFG3P39925 YPR064WYPR064W 420 nt12.3□□□□□ -0.44
AFG3P39925 TAD3YLR316C 969 nt12.27□□□□□ -0.45
AFG3P39925 WSC2YNL283C 1512 nt12.26□□□□□ -0.45
AFG3P39925 NAT4YMR069W 858 nt12.25□□□□□ -0.45
AFG3P39925 Q0182Q0182 405 nt12.23□□□□□ -0.45
AFG3P39925 PEX25YPL112C 1185 nt12.22□□□□□ -0.45
AFG3P39925 GIS3YLR094C 1509 nt12.2□□□□□ -0.46
AFG3P39925 AHT1YHR093W 549 nt12.19□□□□□ -0.46
AFG3P39925 EMI2YDR516C 1503 nt12.19□□□□□ -0.46
AFG3P39925 PCM1YEL058W 1674 nt12.17□□□□□ -0.46
AFG3P39925 YDL221WYDL221W 552 nt12.16□□□□□ -0.46
AFG3P39925 YIL100WYIL100W 354 nt12.14□□□□□ -0.47
AFG3P39925 YMR244WYMR244W 1068 nt12.14□□□□□ -0.47
AFG3P39925 RNQ1YCL028W 1218 nt12.14□□□□□ -0.47
AFG3P39925 GLK1YCL040W 1503 nt12.13□□□□□ -0.47
AFG3P39925 MSF1YPR047W 1410 nt12.11□□□□□ -0.47
AFG3P39925 YSP3YOR003W 1437 nt12.11□□□□□ -0.47
AFG3P39925 YNL115CYNL115C 1935 nt12.1□□□□□ -0.47
AFG3P39925 YIH1YCR059C 777 nt12.1□□□□□ -0.47
AFG3P39925 BDH1YAL060W 1149 nt12.08□□□□□ -0.48
AFG3P39925 THI74YDR438W 1113 nt12.03□□□□□ -0.48
AFG3P39925 MIR1YJR077C 936 nt12.03□□□□□ -0.48
AFG3P39925 YSC84YHR016C 1407 nt11.98□□□□□ -0.49
AFG3P39925 YLL053CYLL053C 459 nt11.96□□□□□ -0.49
AFG3P39925 YLR415CYLR415C 339 nt11.96□□□□□ -0.49
AFG3P39925 YMR090WYMR090W 684 nt11.95□□□□□ -0.5
AFG3P39925 GLR1YPL091W 1452 nt11.93□□□□□ -0.5
AFG3P39925 BDF1YLR399C 2061 nt11.92□□□□□ -0.5
AFG3P39925 SCC4YER147C 1875 nt11.92□□□□□ -0.5
AFG3P39925 FTR1YER145C 1215 nt11.92□□□□□ -0.5
AFG3P39925 AQY1YPR192W 918 nt11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms