Protein–RNA interactions for Protein: P39520

IFH1, Protein IFH1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IFH1P39520 SUF2tP(AGG)C 72 nt18.51■□□□□ 0.55
IFH1P39520 SUF10tP(AGG)N 72 nt18.51■□□□□ 0.55
IFH1P39520 IMP2'YIL154C 1041 nt18.5■□□□□ 0.55
IFH1P39520 YDR095CYDR095C 411 nt18.49■□□□□ 0.55
IFH1P39520 YCH1YGR203W 447 nt18.43■□□□□ 0.54
IFH1P39520 SIS1YNL007C 1059 nt18.36■□□□□ 0.53
IFH1P39520 YJL152WYJL152W 360 nt18.35■□□□□ 0.53
IFH1P39520 LPX1YOR084W 1164 nt18.31■□□□□ 0.52
IFH1P39520 TIR4YOR009W 1464 nt18.25■□□□□ 0.51
IFH1P39520 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt18.24■□□□□ 0.51
IFH1P39520 ERV46YAL042W 1248 nt18.24■□□□□ 0.51
IFH1P39520 SPP1YPL138C 1062 nt18.21■□□□□ 0.51
IFH1P39520 Q0182Q0182 405 nt18.2■□□□□ 0.5
IFH1P39520 MRPL8YJL063C 717 nt18.18■□□□□ 0.5
IFH1P39520 IDH1YNL037C 1083 nt18.17■□□□□ 0.5
IFH1P39520 SPT5YML010W 3192 nt18.12■□□□□ 0.49
IFH1P39520 RPP2AYOL039W 321 nt18.12■□□□□ 0.49
IFH1P39520 PTP1YDL230W 1008 nt18.11■□□□□ 0.49
IFH1P39520 YDR433WYDR433W 441 nt18.07■□□□□ 0.48
IFH1P39520 ART5YGR068C 1761 nt18.04■□□□□ 0.48
IFH1P39520 MEP2YNL142W 1500 nt18.03■□□□□ 0.48
IFH1P39520 YKR040CYKR040C 504 nt18.02■□□□□ 0.48
IFH1P39520 RTG1YOL067C 534 nt18■□□□□ 0.47
IFH1P39520 GBP2YCL011C 1284 nt18■□□□□ 0.47
IFH1P39520 MXR2YCL033C 507 nt18■□□□□ 0.47
IFH1P39520 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt17.96■□□□□ 0.47
IFH1P39520 YEL076CYEL076C 651 nt17.96■□□□□ 0.47
IFH1P39520 YLR464WYLR464W 651 nt17.96■□□□□ 0.47
IFH1P39520 YMR057CYMR057C 372 nt17.96■□□□□ 0.47
IFH1P39520 CAC2YML102W 1407 nt17.95■□□□□ 0.46
IFH1P39520 PET9YBL030C 957 nt17.94■□□□□ 0.46
IFH1P39520 GFD2YCL036W 1701 nt17.93■□□□□ 0.46
IFH1P39520 ADO1YJR105W 1023 nt17.88■□□□□ 0.45
IFH1P39520 DCW1YKL046C 1350 nt17.82■□□□□ 0.44
IFH1P39520 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt17.79■□□□□ 0.44
IFH1P39520 UBX6YJL048C 1191 nt17.77■□□□□ 0.44
IFH1P39520 DED1YOR204W 1815 nt17.72■□□□□ 0.43
IFH1P39520 TCD2YKL027W 1344 nt17.71■□□□□ 0.42
IFH1P39520 FPS1YLL043W 2010 nt17.7■□□□□ 0.42
IFH1P39520 RRD1YIL153W 1182 nt17.67■□□□□ 0.42
IFH1P39520 RTS2YOR077W 699 nt17.65■□□□□ 0.42
IFH1P39520 FRD1YEL047C 1413 nt17.64■□□□□ 0.42
IFH1P39520 IRC15YPL017C 1500 nt17.59■□□□□ 0.41
IFH1P39520 EMI2YDR516C 1503 nt17.57■□□□□ 0.4
IFH1P39520 FMT1YBL013W 1206 nt17.54■□□□□ 0.4
IFH1P39520 HUA1YGR268C 597 nt17.51■□□□□ 0.39
IFH1P39520 YDL221WYDL221W 552 nt17.49■□□□□ 0.39
IFH1P39520 CUE1YMR264W 612 nt17.46■□□□□ 0.39
IFH1P39520 PTH1YHR189W 573 nt17.43■□□□□ 0.38
IFH1P39520 SOR2YDL246C 1074 nt17.42■□□□□ 0.38
IFH1P39520 SOR1YJR159W 1074 nt17.42■□□□□ 0.38
IFH1P39520 GIS3YLR094C 1509 nt17.42■□□□□ 0.38
IFH1P39520 YDR094WYDR094W 336 nt17.39■□□□□ 0.37
IFH1P39520 YCL042WYCL042W 360 nt17.35■□□□□ 0.37
IFH1P39520 YKL030WYKL030W 606 nt17.3■□□□□ 0.36
IFH1P39520 YLR235CYLR235C 399 nt17.27■□□□□ 0.36
IFH1P39520 YMR090WYMR090W 684 nt17.26■□□□□ 0.35
IFH1P39520 LCB1YMR296C 1677 nt17.24■□□□□ 0.35
IFH1P39520 FMP52YER004W 696 nt17.23■□□□□ 0.35
IFH1P39520 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt17.22■□□□□ 0.35
IFH1P39520 CWP1YKL096W 720 nt17.2■□□□□ 0.34
IFH1P39520 ADH2YMR303C 1047 nt17.19■□□□□ 0.34
IFH1P39520 SDH1YKL148C 1923 nt17.17■□□□□ 0.34
IFH1P39520 YIL100WYIL100W 354 nt17.15■□□□□ 0.34
IFH1P39520 SCC4YER147C 1875 nt17.14■□□□□ 0.33
IFH1P39520 SSA4YER103W 1929 nt17.12■□□□□ 0.33
IFH1P39520 YBR220CYBR220C 1683 nt17.1■□□□□ 0.33
IFH1P39520 PCM1YEL058W 1674 nt17.01■□□□□ 0.31
IFH1P39520 TIM23YNR017W 669 nt17■□□□□ 0.31
IFH1P39520 DIC1YLR348C 897 nt16.99■□□□□ 0.31
IFH1P39520 SNF6YHL025W 999 nt16.93■□□□□ 0.3
IFH1P39520 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt16.88■□□□□ 0.29
IFH1P39520 YFR018CYFR018C 1092 nt16.87■□□□□ 0.29
IFH1P39520 PAU16YKL224C 372 nt16.86■□□□□ 0.29
IFH1P39520 YLR179CYLR179C 606 nt16.86■□□□□ 0.29
IFH1P39520 RNQ1YCL028W 1218 nt16.86■□□□□ 0.29
IFH1P39520 YIH1YCR059C 777 nt16.85■□□□□ 0.29
IFH1P39520 PRE6YOL038W 765 nt16.85■□□□□ 0.29
IFH1P39520 WSC2YNL283C 1512 nt16.81■□□□□ 0.28
IFH1P39520 RRT12YCR045C 1476 nt16.79■□□□□ 0.28
IFH1P39520 YPR064WYPR064W 420 nt16.76■□□□□ 0.27
IFH1P39520 AHT1YHR093W 549 nt16.75■□□□□ 0.27
IFH1P39520 TAD3YLR316C 969 nt16.73■□□□□ 0.27
IFH1P39520 YNL195CYNL195C 786 nt16.71■□□□□ 0.27
IFH1P39520 SBA1YKL117W 651 nt16.68■□□□□ 0.26
IFH1P39520 YLL053CYLL053C 459 nt16.67■□□□□ 0.26
IFH1P39520 RRT5YFR032C 870 nt16.66■□□□□ 0.26
IFH1P39520 YSC84YHR016C 1407 nt16.66■□□□□ 0.26
IFH1P39520 YHL050CYHL050C 2094 nt16.66■□□□□ 0.26
IFH1P39520 BIO4YNR057C 714 nt16.65■□□□□ 0.26
IFH1P39520 YFL066CYFL066C 1179 nt16.6■□□□□ 0.25
IFH1P39520 FTR1YER145C 1215 nt16.58■□□□□ 0.24
IFH1P39520 SIM1YIL123W 1431 nt16.55■□□□□ 0.24
IFH1P39520 GAL1YBR020W 1587 nt16.55■□□□□ 0.24
IFH1P39520 BDH1YAL060W 1149 nt16.53■□□□□ 0.24
IFH1P39520 PEX25YPL112C 1185 nt16.51■□□□□ 0.23
IFH1P39520 AQY1YPR192W 918 nt16.51■□□□□ 0.23
IFH1P39520 YSP3YOR003W 1437 nt16.5■□□□□ 0.23
IFH1P39520 TRM5YHR070W 1500 nt16.48■□□□□ 0.23
IFH1P39520 BDF1YLR399C 2061 nt16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.4 ms