Protein–RNA interactions for Protein: P38962

TVP23, Golgi apparatus membrane protein TVP23, yeastyeast

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP23P38962 MRPL8YJL063C 717 nt13.34□□□□□ -0.27
TVP23P38962 LPX1YOR084W 1164 nt13.23□□□□□ -0.29
TVP23P38962 SPP1YPL138C 1062 nt13.21□□□□□ -0.29
TVP23P38962 YJL152WYJL152W 360 nt13.17□□□□□ -0.3
TVP23P38962 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.16□□□□□ -0.3
TVP23P38962 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.16□□□□□ -0.3
TVP23P38962 ERV46YAL042W 1248 nt13.15□□□□□ -0.3
TVP23P38962 ALF1YNL148C 765 nt13.15□□□□□ -0.3
TVP23P38962 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.12□□□□□ -0.31
TVP23P38962 YEL076CYEL076C 651 nt13.12□□□□□ -0.31
TVP23P38962 UBX6YJL048C 1191 nt13.12□□□□□ -0.31
TVP23P38962 ADO1YJR105W 1023 nt13.12□□□□□ -0.31
TVP23P38962 YLR464WYLR464W 651 nt13.12□□□□□ -0.31
TVP23P38962 RTG1YOL067C 534 nt13.1□□□□□ -0.31
TVP23P38962 IDH1YNL037C 1083 nt13.07□□□□□ -0.32
TVP23P38962 YPS1YLR120C 1710 nt13.03□□□□□ -0.32
TVP23P38962 YDR095CYDR095C 411 nt13.03□□□□□ -0.32
TVP23P38962 YDR433WYDR433W 441 nt13.03□□□□□ -0.32
TVP23P38962 SIS1YNL007C 1059 nt13.02□□□□□ -0.33
TVP23P38962 YKR040CYKR040C 504 nt13□□□□□ -0.33
TVP23P38962 TIR4YOR009W 1464 nt12.97□□□□□ -0.33
TVP23P38962 MXR2YCL033C 507 nt12.94□□□□□ -0.34
TVP23P38962 GBP2YCL011C 1284 nt12.92□□□□□ -0.34
TVP23P38962 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.84□□□□□ -0.35
TVP23P38962 CAC2YML102W 1407 nt12.79□□□□□ -0.36
TVP23P38962 RPP2AYOL039W 321 nt12.78□□□□□ -0.36
TVP23P38962 ART5YGR068C 1761 nt12.77□□□□□ -0.36
TVP23P38962 HUA1YGR268C 597 nt12.77□□□□□ -0.37
TVP23P38962 YMR057CYMR057C 372 nt12.77□□□□□ -0.37
TVP23P38962 YDR094WYDR094W 336 nt12.74□□□□□ -0.37
TVP23P38962 PTP1YDL230W 1008 nt12.73□□□□□ -0.37
TVP23P38962 PET9YBL030C 957 nt12.7□□□□□ -0.38
TVP23P38962 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.7□□□□□ -0.38
TVP23P38962 TCD2YKL027W 1344 nt12.68□□□□□ -0.38
TVP23P38962 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.68□□□□□ -0.38
TVP23P38962 GFD2YCL036W 1701 nt12.66□□□□□ -0.38
TVP23P38962 FRD1YEL047C 1413 nt12.65□□□□□ -0.38
TVP23P38962 DED1YOR204W 1815 nt12.64□□□□□ -0.39
TVP23P38962 MEP2YNL142W 1500 nt12.58□□□□□ -0.4
TVP23P38962 RRD1YIL153W 1182 nt12.58□□□□□ -0.4
TVP23P38962 PTH1YHR189W 573 nt12.57□□□□□ -0.4
TVP23P38962 FPS1YLL043W 2010 nt12.52□□□□□ -0.4
TVP23P38962 YKL030WYKL030W 606 nt12.5□□□□□ -0.41
TVP23P38962 FMT1YBL013W 1206 nt12.5□□□□□ -0.41
TVP23P38962 SPT5YML010W 3192 nt12.49□□□□□ -0.41
TVP23P38962 RTS2YOR077W 699 nt12.46□□□□□ -0.41
TVP23P38962 YLR235CYLR235C 399 nt12.45□□□□□ -0.42
TVP23P38962 YCL042WYCL042W 360 nt12.45□□□□□ -0.42
TVP23P38962 DCW1YKL046C 1350 nt12.44□□□□□ -0.42
TVP23P38962 LCB1YMR296C 1677 nt12.43□□□□□ -0.42
TVP23P38962 SOR2YDL246C 1074 nt12.43□□□□□ -0.42
TVP23P38962 SOR1YJR159W 1074 nt12.43□□□□□ -0.42
TVP23P38962 SBA1YKL117W 651 nt12.35□□□□□ -0.43
TVP23P38962 IRC15YPL017C 1500 nt12.34□□□□□ -0.43
TVP23P38962 PAU16YKL224C 372 nt12.32□□□□□ -0.44
TVP23P38962 CUE1YMR264W 612 nt12.3□□□□□ -0.44
TVP23P38962 EMI2YDR516C 1503 nt12.28□□□□□ -0.44
TVP23P38962 CWP1YKL096W 720 nt12.27□□□□□ -0.45
TVP23P38962 YFR018CYFR018C 1092 nt12.25□□□□□ -0.45
TVP23P38962 ADH2YMR303C 1047 nt12.25□□□□□ -0.45
TVP23P38962 FMP52YER004W 696 nt12.24□□□□□ -0.45
TVP23P38962 PRE6YOL038W 765 nt12.24□□□□□ -0.45
TVP23P38962 YDL221WYDL221W 552 nt12.22□□□□□ -0.45
TVP23P38962 GIS3YLR094C 1509 nt12.21□□□□□ -0.45
TVP23P38962 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.21□□□□□ -0.45
TVP23P38962 TIM23YNR017W 669 nt12.21□□□□□ -0.45
TVP23P38962 RRT5YFR032C 870 nt12.17□□□□□ -0.46
TVP23P38962 DIC1YLR348C 897 nt12.16□□□□□ -0.46
TVP23P38962 YIL100WYIL100W 354 nt12.12□□□□□ -0.47
TVP23P38962 YLR179CYLR179C 606 nt12.11□□□□□ -0.47
TVP23P38962 PCM1YEL058W 1674 nt12.07□□□□□ -0.48
TVP23P38962 YMR090WYMR090W 684 nt12.07□□□□□ -0.48
TVP23P38962 YPR064WYPR064W 420 nt12.06□□□□□ -0.48
TVP23P38962 SNF6YHL025W 999 nt12.05□□□□□ -0.48
TVP23P38962 WSC2YNL283C 1512 nt12.04□□□□□ -0.48
TVP23P38962 TAD3YLR316C 969 nt12.03□□□□□ -0.48
TVP23P38962 YFL066CYFL066C 1179 nt12.01□□□□□ -0.49
TVP23P38962 RNQ1YCL028W 1218 nt12.01□□□□□ -0.49
TVP23P38962 AHT1YHR093W 549 nt12□□□□□ -0.49
TVP23P38962 SCC4YER147C 1875 nt12□□□□□ -0.49
TVP23P38962 YIH1YCR059C 777 nt11.98□□□□□ -0.49
TVP23P38962 SDH1YKL148C 1923 nt11.98□□□□□ -0.49
TVP23P38962 PEX25YPL112C 1185 nt11.91□□□□□ -0.5
TVP23P38962 YBR220CYBR220C 1683 nt11.87□□□□□ -0.51
TVP23P38962 NAT4YMR069W 858 nt11.86□□□□□ -0.51
TVP23P38962 YSP3YOR003W 1437 nt11.86□□□□□ -0.51
TVP23P38962 BDH1YAL060W 1149 nt11.85□□□□□ -0.51
TVP23P38962 YLL053CYLL053C 459 nt11.85□□□□□ -0.51
TVP23P38962 YNL115CYNL115C 1935 nt11.83□□□□□ -0.52
TVP23P38962 YSC84YHR016C 1407 nt11.82□□□□□ -0.52
TVP23P38962 FTR1YER145C 1215 nt11.8□□□□□ -0.52
TVP23P38962 BIO4YNR057C 714 nt11.79□□□□□ -0.52
TVP23P38962 GAL1YBR020W 1587 nt11.77□□□□□ -0.53
TVP23P38962 AQY1YPR192W 918 nt11.77□□□□□ -0.53
TVP23P38962 RRT12YCR045C 1476 nt11.76□□□□□ -0.53
TVP23P38962 GLK1YCL040W 1503 nt11.76□□□□□ -0.53
TVP23P38962 YNL195CYNL195C 786 nt11.76□□□□□ -0.53
TVP23P38962 SSA4YER103W 1929 nt11.75□□□□□ -0.53
TVP23P38962 YLR415CYLR415C 339 nt11.74□□□□□ -0.53
TVP23P38962 MSF1YPR047W 1410 nt11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms