Protein–RNA interactions for Protein: P38873

KOG1, Target of rapamycin complex 1 subunit KOG1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
KOG1P38873 YBL100CYBL100C 315 nt21.82■■□□□ 1.08
KOG1P38873 PTC2YER089C 1395 nt21.82■■□□□ 1.08
KOG1P38873 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt21.78■■□□□ 1.08
KOG1P38873 YDR433WYDR433W 441 nt21.73■■□□□ 1.07
KOG1P38873 PUT4YOR348C 1884 nt21.68■■□□□ 1.06
KOG1P38873 IDH1YNL037C 1083 nt21.68■■□□□ 1.06
KOG1P38873 YJL152WYJL152W 360 nt21.65■■□□□ 1.06
KOG1P38873 TRM9YML014W 840 nt21.61■■□□□ 1.05
KOG1P38873 YKR040CYKR040C 504 nt21.59■■□□□ 1.05
KOG1P38873 FPR4YLR449W 1179 nt21.58■■□□□ 1.05
KOG1P38873 PAU16YKL224C 372 nt21.57■■□□□ 1.04
KOG1P38873 MXR2YCL033C 507 nt21.56■■□□□ 1.04
KOG1P38873 FUN26YAL022C 1554 nt21.48■■□□□ 1.03
KOG1P38873 INM2YDR287W 879 nt21.44■■□□□ 1.02
KOG1P38873 FIS1YIL065C 468 nt21.44■■□□□ 1.02
KOG1P38873 CCT6YDR188W 1641 nt21.38■■□□□ 1.01
KOG1P38873 BUD23YCR047C 828 nt21.35■■□□□ 1.01
KOG1P38873 DAL1YIR027C 1383 nt21.32■■□□□ 1
KOG1P38873 PHO4YFR034C 939 nt21.31■■□□□ 1
KOG1P38873 GBP2YCL011C 1284 nt21.3■■□□□ 1
KOG1P38873 NAB2YGL122C 1578 nt21.28■■□□□ 1
KOG1P38873 POA1YBR022W 534 nt21.21■□□□□ 0.99
KOG1P38873 PTH1YHR189W 573 nt21.19■□□□□ 0.98
KOG1P38873 SUF2tP(AGG)C 72 nt21.1■□□□□ 0.97
KOG1P38873 SUF10tP(AGG)N 72 nt21.1■□□□□ 0.97
KOG1P38873 PRE6YOL038W 765 nt21.1■□□□□ 0.97
KOG1P38873 RRT5YFR032C 870 nt21■□□□□ 0.95
KOG1P38873 YFR018CYFR018C 1092 nt20.99■□□□□ 0.95
KOG1P38873 YPS1YLR120C 1710 nt20.95■□□□□ 0.94
KOG1P38873 YLR235CYLR235C 399 nt20.94■□□□□ 0.94
KOG1P38873 ALF1YNL148C 765 nt20.94■□□□□ 0.94
KOG1P38873 YKL030WYKL030W 606 nt20.93■□□□□ 0.94
KOG1P38873 SNF6YHL025W 999 nt20.92■□□□□ 0.94
KOG1P38873 TIR4YOR009W 1464 nt20.88■□□□□ 0.93
KOG1P38873 FRD1YEL047C 1413 nt20.87■□□□□ 0.93
KOG1P38873 TCD2YKL027W 1344 nt20.81■□□□□ 0.92
KOG1P38873 LCB1YMR296C 1677 nt20.79■□□□□ 0.92
KOG1P38873 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt20.66■□□□□ 0.9
KOG1P38873 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt20.63■□□□□ 0.89
KOG1P38873 CAC2YML102W 1407 nt20.51■□□□□ 0.87
KOG1P38873 NAT4YMR069W 858 nt20.49■□□□□ 0.87
KOG1P38873 YCL042WYCL042W 360 nt20.48■□□□□ 0.87
KOG1P38873 DED1YOR204W 1815 nt20.47■□□□□ 0.87
KOG1P38873 DIC1YLR348C 897 nt20.46■□□□□ 0.87
KOG1P38873 TIM23YNR017W 669 nt20.46■□□□□ 0.87
KOG1P38873 YMR244WYMR244W 1068 nt20.45■□□□□ 0.86
KOG1P38873 SOR2YDL246C 1074 nt20.4■□□□□ 0.86
KOG1P38873 YDR095CYDR095C 411 nt20.4■□□□□ 0.86
KOG1P38873 SOR1YJR159W 1074 nt20.4■□□□□ 0.86
KOG1P38873 YMR057CYMR057C 372 nt20.32■□□□□ 0.84
KOG1P38873 RRD1YIL153W 1182 nt20.28■□□□□ 0.84
KOG1P38873 GLK1YCL040W 1503 nt20.24■□□□□ 0.83
KOG1P38873 YFL066CYFL066C 1179 nt20.2■□□□□ 0.82
KOG1P38873 MSF1YPR047W 1410 nt20.16■□□□□ 0.82
KOG1P38873 PEX25YPL112C 1185 nt20.15■□□□□ 0.82
KOG1P38873 ART5YGR068C 1761 nt20.15■□□□□ 0.82
KOG1P38873 FMT1YBL013W 1206 nt20.14■□□□□ 0.81
KOG1P38873 GLR1YPL091W 1452 nt20.11■□□□□ 0.81
KOG1P38873 RBG2YGR173W 1107 nt20.11■□□□□ 0.81
KOG1P38873 RPM1RPM1 483 nt20.05■□□□□ 0.8
KOG1P38873 YLR179CYLR179C 606 nt20.04■□□□□ 0.8
KOG1P38873 YPR064WYPR064W 420 nt20.01■□□□□ 0.79
KOG1P38873 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt20■□□□□ 0.79
KOG1P38873 GFD2YCL036W 1701 nt19.98■□□□□ 0.79
KOG1P38873 PET9YBL030C 957 nt19.97■□□□□ 0.79
KOG1P38873 RPP2AYOL039W 321 nt19.92■□□□□ 0.78
KOG1P38873 TAD3YLR316C 969 nt19.9■□□□□ 0.78
KOG1P38873 THI74YDR438W 1113 nt19.89■□□□□ 0.77
KOG1P38873 MIR1YJR077C 936 nt19.88■□□□□ 0.77
KOG1P38873 RAD51YER095W 1203 nt19.87■□□□□ 0.77
KOG1P38873 CWP1YKL096W 720 nt19.86■□□□□ 0.77
KOG1P38873 WSC2YNL283C 1512 nt19.79■□□□□ 0.76
KOG1P38873 FPS1YLL043W 2010 nt19.78■□□□□ 0.76
KOG1P38873 YNL115CYNL115C 1935 nt19.77■□□□□ 0.76
KOG1P38873 RTS2YOR077W 699 nt19.75■□□□□ 0.75
KOG1P38873 PTP1YDL230W 1008 nt19.7■□□□□ 0.74
KOG1P38873 ADH2YMR303C 1047 nt19.69■□□□□ 0.74
KOG1P38873 FMP52YER004W 696 nt19.66■□□□□ 0.74
KOG1P38873 YSP3YOR003W 1437 nt19.64■□□□□ 0.73
KOG1P38873 SAM1YLR180W 1149 nt19.61■□□□□ 0.73
KOG1P38873 AHT1YHR093W 549 nt19.57■□□□□ 0.72
KOG1P38873 NDI1YML120C 1542 nt19.57■□□□□ 0.72
KOG1P38873 DAT1YML113W 747 nt19.53■□□□□ 0.72
KOG1P38873 BDH1YAL060W 1149 nt19.49■□□□□ 0.71
KOG1P38873 YGL034CYGL034C 366 nt19.44■□□□□ 0.7
KOG1P38873 YLR415CYLR415C 339 nt19.44■□□□□ 0.7
KOG1P38873 YNR029CYNR029C 1290 nt19.43■□□□□ 0.7
KOG1P38873 VPS75YNL246W 795 nt19.4■□□□□ 0.7
KOG1P38873 RBG1YAL036C 1110 nt19.36■□□□□ 0.69
KOG1P38873 RNQ1YCL028W 1218 nt19.29■□□□□ 0.68
KOG1P38873 CUE1YMR264W 612 nt19.28■□□□□ 0.68
KOG1P38873 YSC84YHR016C 1407 nt19.24■□□□□ 0.67
KOG1P38873 YIH1YCR059C 777 nt19.23■□□□□ 0.67
KOG1P38873 PAU7YAR020C 168 nt19.23■□□□□ 0.67
KOG1P38873 ADH7YCR105W 1086 nt19.22■□□□□ 0.67
KOG1P38873 UBA4YHR111W 1323 nt19.19■□□□□ 0.66
KOG1P38873 YMR226CYMR226C 804 nt19.15■□□□□ 0.66
KOG1P38873 YLR349WYLR349W 507 nt19.15■□□□□ 0.66
KOG1P38873 PCM1YEL058W 1674 nt19.14■□□□□ 0.65
KOG1P38873 XYL2YLR070C 1071 nt19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.3 ms