Protein–RNA interactions for Protein: P38349

UBX7, UBX domain-containing protein 7, yeastyeast

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX7P38349 ALF1YNL148C 765 nt13.2□□□□□ -0.3
UBX7P38349 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.17□□□□□ -0.3
UBX7P38349 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.17□□□□□ -0.3
UBX7P38349 IMP2'YIL154C 1041 nt13.17□□□□□ -0.3
UBX7P38349 YCH1YGR203W 447 nt13.13□□□□□ -0.31
UBX7P38349 YJL152WYJL152W 360 nt13.12□□□□□ -0.31
UBX7P38349 YPS1YLR120C 1710 nt13.1□□□□□ -0.31
UBX7P38349 YDR095CYDR095C 411 nt13.08□□□□□ -0.32
UBX7P38349 LPX1YOR084W 1164 nt13.02□□□□□ -0.33
UBX7P38349 SIS1YNL007C 1059 nt13□□□□□ -0.33
UBX7P38349 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.96□□□□□ -0.33
UBX7P38349 YGR139WYGR139W 339 nt12.95□□□□□ -0.34
UBX7P38349 IDH1YNL037C 1083 nt12.95□□□□□ -0.34
UBX7P38349 SPP1YPL138C 1062 nt12.95□□□□□ -0.34
UBX7P38349 ERV46YAL042W 1248 nt12.94□□□□□ -0.34
UBX7P38349 TIR4YOR009W 1464 nt12.93□□□□□ -0.34
UBX7P38349 MRPL8YJL063C 717 nt12.93□□□□□ -0.34
UBX7P38349 YDR433WYDR433W 441 nt12.9□□□□□ -0.34
UBX7P38349 RPP2AYOL039W 321 nt12.84□□□□□ -0.35
UBX7P38349 GBP2YCL011C 1284 nt12.84□□□□□ -0.35
UBX7P38349 YKR040CYKR040C 504 nt12.83□□□□□ -0.36
UBX7P38349 ART5YGR068C 1761 nt12.8□□□□□ -0.36
UBX7P38349 MXR2YCL033C 507 nt12.8□□□□□ -0.36
UBX7P38349 PTP1YDL230W 1008 nt12.79□□□□□ -0.36
UBX7P38349 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.79□□□□□ -0.36
UBX7P38349 YEL076CYEL076C 651 nt12.79□□□□□ -0.36
UBX7P38349 YLR464WYLR464W 651 nt12.79□□□□□ -0.36
UBX7P38349 RTG1YOL067C 534 nt12.77□□□□□ -0.37
UBX7P38349 ADO1YJR105W 1023 nt12.76□□□□□ -0.37
UBX7P38349 YMR057CYMR057C 372 nt12.76□□□□□ -0.37
UBX7P38349 CAC2YML102W 1407 nt12.74□□□□□ -0.37
UBX7P38349 MEP2YNL142W 1500 nt12.73□□□□□ -0.37
UBX7P38349 PET9YBL030C 957 nt12.72□□□□□ -0.37
UBX7P38349 GFD2YCL036W 1701 nt12.69□□□□□ -0.38
UBX7P38349 SPT5YML010W 3192 nt12.69□□□□□ -0.38
UBX7P38349 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.68□□□□□ -0.38
UBX7P38349 UBX6YJL048C 1191 nt12.67□□□□□ -0.38
UBX7P38349 TCD2YKL027W 1344 nt12.61□□□□□ -0.39
UBX7P38349 DCW1YKL046C 1350 nt12.59□□□□□ -0.39
UBX7P38349 DED1YOR204W 1815 nt12.54□□□□□ -0.4
UBX7P38349 RTS2YOR077W 699 nt12.52□□□□□ -0.41
UBX7P38349 FPS1YLL043W 2010 nt12.52□□□□□ -0.41
UBX7P38349 RRD1YIL153W 1182 nt12.51□□□□□ -0.41
UBX7P38349 FRD1YEL047C 1413 nt12.51□□□□□ -0.41
UBX7P38349 HUA1YGR268C 597 nt12.5□□□□□ -0.41
UBX7P38349 EMI2YDR516C 1503 nt12.42□□□□□ -0.42
UBX7P38349 IRC15YPL017C 1500 nt12.42□□□□□ -0.42
UBX7P38349 PTH1YHR189W 573 nt12.42□□□□□ -0.42
UBX7P38349 FMT1YBL013W 1206 nt12.41□□□□□ -0.42
UBX7P38349 YCL042WYCL042W 360 nt12.38□□□□□ -0.43
UBX7P38349 YDR094WYDR094W 336 nt12.37□□□□□ -0.43
UBX7P38349 YDL221WYDL221W 552 nt12.36□□□□□ -0.43
UBX7P38349 CUE1YMR264W 612 nt12.36□□□□□ -0.43
UBX7P38349 GIS3YLR094C 1509 nt12.32□□□□□ -0.44
UBX7P38349 SOR2YDL246C 1074 nt12.32□□□□□ -0.44
UBX7P38349 SOR1YJR159W 1074 nt12.32□□□□□ -0.44
UBX7P38349 YKL030WYKL030W 606 nt12.32□□□□□ -0.44
UBX7P38349 YLR235CYLR235C 399 nt12.29□□□□□ -0.44
UBX7P38349 LCB1YMR296C 1677 nt12.26□□□□□ -0.45
UBX7P38349 CWP1YKL096W 720 nt12.25□□□□□ -0.45
UBX7P38349 YMR090WYMR090W 684 nt12.25□□□□□ -0.45
UBX7P38349 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.24□□□□□ -0.45
UBX7P38349 FMP52YER004W 696 nt12.21□□□□□ -0.45
UBX7P38349 ADH2YMR303C 1047 nt12.21□□□□□ -0.45
UBX7P38349 YIL100WYIL100W 354 nt12.2□□□□□ -0.46
UBX7P38349 SCC4YER147C 1875 nt12.13□□□□□ -0.47
UBX7P38349 CSM2YIL132C 642 nt12.13□□□□□ -0.47
UBX7P38349 SDH1YKL148C 1923 nt12.12□□□□□ -0.47
UBX7P38349 DIC1YLR348C 897 nt12.08□□□□□ -0.48
UBX7P38349 TIM23YNR017W 669 nt12.08□□□□□ -0.48
UBX7P38349 PCM1YEL058W 1674 nt12.07□□□□□ -0.48
UBX7P38349 YBR220CYBR220C 1683 nt12.06□□□□□ -0.48
UBX7P38349 SSA4YER103W 1929 nt12.04□□□□□ -0.48
UBX7P38349 SNF6YHL025W 999 nt12.04□□□□□ -0.48
UBX7P38349 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.01□□□□□ -0.49
UBX7P38349 YLR179CYLR179C 606 nt12.01□□□□□ -0.49
UBX7P38349 PAU16YKL224C 372 nt12□□□□□ -0.49
UBX7P38349 YFR018CYFR018C 1092 nt11.98□□□□□ -0.49
UBX7P38349 PRE6YOL038W 765 nt11.97□□□□□ -0.49
UBX7P38349 RNQ1YCL028W 1218 nt11.96□□□□□ -0.49
UBX7P38349 YIH1YCR059C 777 nt11.94□□□□□ -0.5
UBX7P38349 YPR064WYPR064W 420 nt11.94□□□□□ -0.5
UBX7P38349 RRT5YFR032C 870 nt11.91□□□□□ -0.5
UBX7P38349 WSC2YNL283C 1512 nt11.91□□□□□ -0.5
UBX7P38349 TAD3YLR316C 969 nt11.9□□□□□ -0.5
UBX7P38349 YNL195CYNL195C 786 nt11.9□□□□□ -0.5
UBX7P38349 RRT12YCR045C 1476 nt11.89□□□□□ -0.51
UBX7P38349 SBA1YKL117W 651 nt11.88□□□□□ -0.51
UBX7P38349 AHT1YHR093W 549 nt11.87□□□□□ -0.51
UBX7P38349 YLL053CYLL053C 459 nt11.83□□□□□ -0.52
UBX7P38349 YFL066CYFL066C 1179 nt11.82□□□□□ -0.52
UBX7P38349 MET8YBR213W 825 nt11.8□□□□□ -0.52
UBX7P38349 BIO4YNR057C 714 nt11.79□□□□□ -0.52
UBX7P38349 YSC84YHR016C 1407 nt11.78□□□□□ -0.52
UBX7P38349 SIM1YIL123W 1431 nt11.77□□□□□ -0.53
UBX7P38349 FTR1YER145C 1215 nt11.76□□□□□ -0.53
UBX7P38349 YHL050CYHL050C 2094 nt11.75□□□□□ -0.53
UBX7P38349 PAU21YOR394W 495 nt11.74□□□□□ -0.53
UBX7P38349 PAU22YPL282C 495 nt11.74□□□□□ -0.53
UBX7P38349 GAL1YBR020W 1587 nt11.74□□□□□ -0.53
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