Protein–RNA interactions for Protein: P38137

PCS60, Peroxisomal-coenzyme A synthetase, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PCS60P38137 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.25□□□□□ -0.13
PCS60P38137 CSM2YIL132C 642 nt14.23□□□□□ -0.13
PCS60P38137 NAB2YGL122C 1578 nt14.21□□□□□ -0.14
PCS60P38137 FPR4YLR449W 1179 nt14.18□□□□□ -0.14
PCS60P38137 BUD23YCR047C 828 nt14.16□□□□□ -0.14
PCS60P38137 SPP1YPL138C 1062 nt14.16□□□□□ -0.14
PCS60P38137 DAL1YIR027C 1383 nt14.15□□□□□ -0.14
PCS60P38137 RTG1YOL067C 534 nt14.14□□□□□ -0.15
PCS60P38137 LPX1YOR084W 1164 nt14.14□□□□□ -0.15
PCS60P38137 FUN26YAL022C 1554 nt14.13□□□□□ -0.15
PCS60P38137 SIS1YNL007C 1059 nt14.13□□□□□ -0.15 RIP-Chip
PCS60P38137 ERV46YAL042W 1248 nt14.07□□□□□ -0.16
PCS60P38137 CCT6YDR188W 1641 nt14.04□□□□□ -0.16
PCS60P38137 FIS1YIL065C 468 nt14.03□□□□□ -0.16
PCS60P38137 PHO4YFR034C 939 nt14.01□□□□□ -0.17
PCS60P38137 YJL152WYJL152W 360 nt13.99□□□□□ -0.17
PCS60P38137 PAU21YOR394W 495 nt13.98□□□□□ -0.17
PCS60P38137 PAU22YPL282C 495 nt13.98□□□□□ -0.17
PCS60P38137 IDH1YNL037C 1083 nt13.95□□□□□ -0.18 RIP-Chip
PCS60P38137 YDR094WYDR094W 336 nt13.94□□□□□ -0.18
PCS60P38137 YDR433WYDR433W 441 nt13.94□□□□□ -0.18
PCS60P38137 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.91□□□□□ -0.18
PCS60P38137 HUA1YGR268C 597 nt13.91□□□□□ -0.18 RIP-Chip
PCS60P38137 YKR040CYKR040C 504 nt13.9□□□□□ -0.18
PCS60P38137 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.89□□□□□ -0.19
PCS60P38137 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.89□□□□□ -0.19
PCS60P38137 ARO7YPR060C 771 nt13.82□□□□□ -0.2
PCS60P38137 ALF1YNL148C 765 nt13.81□□□□□ -0.2
PCS60P38137 GBP2YCL011C 1284 nt13.74□□□□□ -0.21
PCS60P38137 MXR2YCL033C 507 nt13.73□□□□□ -0.21
PCS60P38137 YPS1YLR120C 1710 nt13.6□□□□□ -0.23
PCS60P38137 SBA1YKL117W 651 nt13.59□□□□□ -0.23
PCS60P38137 TIR4YOR009W 1464 nt13.56□□□□□ -0.24
PCS60P38137 YDR095CYDR095C 411 nt13.49□□□□□ -0.25
PCS60P38137 TCD2YKL027W 1344 nt13.48□□□□□ -0.25 RIP-Chip
PCS60P38137 PAM17YKR065C 594 nt13.47□□□□□ -0.25
PCS60P38137 CAC2YML102W 1407 nt13.46□□□□□ -0.26
PCS60P38137 REG2YBR050C 1017 nt13.44□□□□□ -0.26 RIP-Chip
PCS60P38137 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.43□□□□□ -0.26
PCS60P38137 FRD1YEL047C 1413 nt13.41□□□□□ -0.26
PCS60P38137 PTH1YHR189W 573 nt13.41□□□□□ -0.26
PCS60P38137 YKL030WYKL030W 606 nt13.41□□□□□ -0.26
PCS60P38137 PAU16YKL224C 372 nt13.37□□□□□ -0.27 RIP-Chip
PCS60P38137 YMR057CYMR057C 372 nt13.36□□□□□ -0.27
PCS60P38137 YLR235CYLR235C 399 nt13.34□□□□□ -0.27
PCS60P38137 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.32□□□□□ -0.28
PCS60P38137 ART5YGR068C 1761 nt13.3□□□□□ -0.28
PCS60P38137 DED1YOR204W 1815 nt13.28□□□□□ -0.28
PCS60P38137 LCB1YMR296C 1677 nt13.28□□□□□ -0.28
PCS60P38137 RRT5YFR032C 870 nt13.27□□□□□ -0.29
PCS60P38137 RPP2AYOL039W 321 nt13.27□□□□□ -0.29
PCS60P38137 PET9YBL030C 957 nt13.26□□□□□ -0.29
PCS60P38137 YCL042WYCL042W 360 nt13.26□□□□□ -0.29
PCS60P38137 YFR018CYFR018C 1092 nt13.24□□□□□ -0.29
PCS60P38137 RRD1YIL153W 1182 nt13.19□□□□□ -0.3
PCS60P38137 PRE6YOL038W 765 nt13.15□□□□□ -0.3
PCS60P38137 GFD2YCL036W 1701 nt13.13□□□□□ -0.31 RIP-Chip
PCS60P38137 SOR2YDL246C 1074 nt13.12□□□□□ -0.31
PCS60P38137 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.12□□□□□ -0.31
PCS60P38137 SOR1YJR159W 1074 nt13.12□□□□□ -0.31
PCS60P38137 PTP1YDL230W 1008 nt13.11□□□□□ -0.31
PCS60P38137 BUR6YER159C 429 nt13.09□□□□□ -0.31
PCS60P38137 FMT1YBL013W 1206 nt13.09□□□□□ -0.31
PCS60P38137 SNF6YHL025W 999 nt13.08□□□□□ -0.32
PCS60P38137 SPT5YML010W 3192 nt13.08□□□□□ -0.32 RIP-Chip
PCS60P38137 FPS1YLL043W 2010 nt13.03□□□□□ -0.32
PCS60P38137 Q0010Q0010 387 nt13.02□□□□□ -0.33
PCS60P38137 BMT5YIL096C 1011 nt12.99□□□□□ -0.33
PCS60P38137 DIC1YLR348C 897 nt12.99□□□□□ -0.33
PCS60P38137 TIM23YNR017W 669 nt12.99□□□□□ -0.33
PCS60P38137 YDR509WYDR509W 348 nt12.96□□□□□ -0.33
PCS60P38137 CWP1YKL096W 720 nt12.93□□□□□ -0.34
PCS60P38137 NAT4YMR069W 858 nt12.92□□□□□ -0.34
PCS60P38137 RTS2YOR077W 699 nt12.9□□□□□ -0.34
PCS60P38137 YPR064WYPR064W 420 nt12.9□□□□□ -0.34
PCS60P38137 YLR179CYLR179C 606 nt12.89□□□□□ -0.35
PCS60P38137 FMP52YER004W 696 nt12.88□□□□□ -0.35
PCS60P38137 ARA2YMR041C 1008 nt12.87□□□□□ -0.35
PCS60P38137 YFL066CYFL066C 1179 nt12.86□□□□□ -0.35
PCS60P38137 MEP2YNL142W 1500 nt12.85□□□□□ -0.35 RIP-Chip
PCS60P38137 TAD3YLR316C 969 nt12.84□□□□□ -0.35
PCS60P38137 ADH2YMR303C 1047 nt12.84□□□□□ -0.35 RIP-Chip
PCS60P38137 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt12.82□□□□□ -0.36
PCS60P38137 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.82□□□□□ -0.36
PCS60P38137 MET8YBR213W 825 nt12.8□□□□□ -0.36
PCS60P38137 GLK1YCL040W 1503 nt12.78□□□□□ -0.36
PCS60P38137 SRN2YLR119W 642 nt12.77□□□□□ -0.37
PCS60P38137 PEX25YPL112C 1185 nt12.77□□□□□ -0.37
PCS60P38137 CUE1YMR264W 612 nt12.76□□□□□ -0.37 RIP-Chip
PCS60P38137 YMR244WYMR244W 1068 nt12.75□□□□□ -0.37
PCS60P38137 WSC2YNL283C 1512 nt12.72□□□□□ -0.37
PCS60P38137 MSF1YPR047W 1410 nt12.71□□□□□ -0.37
PCS60P38137 CLB6YGR109C 1143 nt12.71□□□□□ -0.37
PCS60P38137 AHT1YHR093W 549 nt12.71□□□□□ -0.37
PCS60P38137 YLR122CYLR122C 378 nt12.7□□□□□ -0.38
PCS60P38137 DCW1YKL046C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
PCS60P38137 IRC15YPL017C 1500 nt12.67□□□□□ -0.38
PCS60P38137 RNQ1YCL028W 1218 nt12.64□□□□□ -0.39
PCS60P38137 YIL100WYIL100W 354 nt12.63□□□□□ -0.39
PCS60P38137 PCM1YEL058W 1674 nt12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 451.1 ms