Protein–RNA interactions for Protein: P28004

PRP45, Pre-mRNA-processing protein 45, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP45P28004 ADO1YJR105W 1023 nt16.33■□□□□ 0.2
PRP45P28004 PHO4YFR034C 939 nt16.3■□□□□ 0.2
PRP45P28004 CCT6YDR188W 1641 nt16.27■□□□□ 0.2
PRP45P28004 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.27■□□□□ 0.2
PRP45P28004 YEL076CYEL076C 651 nt16.27■□□□□ 0.2
PRP45P28004 YLR464WYLR464W 651 nt16.27■□□□□ 0.2
PRP45P28004 LPX1YOR084W 1164 nt16.23■□□□□ 0.19
PRP45P28004 SPP1YPL138C 1062 nt16.23■□□□□ 0.19
PRP45P28004 ERV46YAL042W 1248 nt16.16■□□□□ 0.18
PRP45P28004 RTG1YOL067C 534 nt16.16■□□□□ 0.18
PRP45P28004 YJL152WYJL152W 360 nt16.09■□□□□ 0.17
PRP45P28004 SIS1YNL007C 1059 nt16.09■□□□□ 0.17
PRP45P28004 SUF2tP(AGG)C 72 nt16.05■□□□□ 0.16
PRP45P28004 SUF10tP(AGG)N 72 nt16.05■□□□□ 0.16
PRP45P28004 IDH1YNL037C 1083 nt16.02■□□□□ 0.16
PRP45P28004 YDR433WYDR433W 441 nt15.98■□□□□ 0.15
PRP45P28004 ALF1YNL148C 765 nt15.98■□□□□ 0.15
PRP45P28004 YKR040CYKR040C 504 nt15.96■□□□□ 0.15
PRP45P28004 YDR094WYDR094W 336 nt15.84■□□□□ 0.13
PRP45P28004 HUA1YGR268C 597 nt15.82■□□□□ 0.12
PRP45P28004 MXR2YCL033C 507 nt15.81■□□□□ 0.12
PRP45P28004 GBP2YCL011C 1284 nt15.8■□□□□ 0.12
PRP45P28004 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.79■□□□□ 0.12
PRP45P28004 YPS1YLR120C 1710 nt15.74■□□□□ 0.11
PRP45P28004 TIR4YOR009W 1464 nt15.74■□□□□ 0.11
PRP45P28004 YDR095CYDR095C 411 nt15.74■□□□□ 0.11
PRP45P28004 CAC2YML102W 1407 nt15.57■□□□□ 0.08
PRP45P28004 TCD2YKL027W 1344 nt15.51■□□□□ 0.07
PRP45P28004 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.51■□□□□ 0.07
PRP45P28004 YMR057CYMR057C 372 nt15.49■□□□□ 0.07
PRP45P28004 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.49■□□□□ 0.07
PRP45P28004 FRD1YEL047C 1413 nt15.47■□□□□ 0.07
PRP45P28004 ART5YGR068C 1761 nt15.47■□□□□ 0.07
PRP45P28004 RPP2AYOL039W 321 nt15.46■□□□□ 0.07
PRP45P28004 PET9YBL030C 957 nt15.41■□□□□ 0.06
PRP45P28004 PTH1YHR189W 573 nt15.4■□□□□ 0.06
PRP45P28004 DED1YOR204W 1815 nt15.4■□□□□ 0.06
PRP45P28004 SBA1YKL117W 651 nt15.38■□□□□ 0.05
PRP45P28004 YKL030WYKL030W 606 nt15.37■□□□□ 0.05
PRP45P28004 PTP1YDL230W 1008 nt15.35■□□□□ 0.05
PRP45P28004 GFD2YCL036W 1701 nt15.31■□□□□ 0.04
PRP45P28004 RRD1YIL153W 1182 nt15.3■□□□□ 0.04
PRP45P28004 YLR235CYLR235C 399 nt15.29■□□□□ 0.04
PRP45P28004 LCB1YMR296C 1677 nt15.25■□□□□ 0.03
PRP45P28004 PAU16YKL224C 372 nt15.24■□□□□ 0.03
PRP45P28004 YCL042WYCL042W 360 nt15.24■□□□□ 0.03
PRP45P28004 SOR2YDL246C 1074 nt15.18■□□□□ 0.02
PRP45P28004 SOR1YJR159W 1074 nt15.18■□□□□ 0.02
PRP45P28004 FMT1YBL013W 1206 nt15.18■□□□□ 0.02
PRP45P28004 FPS1YLL043W 2010 nt15.17■□□□□ 0.02
PRP45P28004 YFR018CYFR018C 1092 nt15.13■□□□□ 0.01
PRP45P28004 MEP2YNL142W 1500 nt15.11■□□□□ 0.01
PRP45P28004 RRT5YFR032C 870 nt15.08■□□□□ 0
PRP45P28004 PRE6YOL038W 765 nt15.06■□□□□ 0
PRP45P28004 RTS2YOR077W 699 nt15.03■□□□□ -0
PRP45P28004 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt15.02■□□□□ -0
PRP45P28004 CWP1YKL096W 720 nt14.94□□□□□ -0.02
PRP45P28004 TIM23YNR017W 669 nt14.94□□□□□ -0.02
PRP45P28004 SPT5YML010W 3192 nt14.92□□□□□ -0.02
PRP45P28004 FMP52YER004W 696 nt14.92□□□□□ -0.02
PRP45P28004 DCW1YKL046C 1350 nt14.92□□□□□ -0.02
PRP45P28004 ADH2YMR303C 1047 nt14.89□□□□□ -0.03
PRP45P28004 SNF6YHL025W 999 nt14.88□□□□□ -0.03
PRP45P28004 DIC1YLR348C 897 nt14.88□□□□□ -0.03
PRP45P28004 CUE1YMR264W 612 nt14.88□□□□□ -0.03
PRP45P28004 IRC15YPL017C 1500 nt14.85□□□□□ -0.03
PRP45P28004 YLR179CYLR179C 606 nt14.82□□□□□ -0.04
PRP45P28004 YPR064WYPR064W 420 nt14.81□□□□□ -0.04
PRP45P28004 TAD3YLR316C 969 nt14.76□□□□□ -0.05
PRP45P28004 YFL066CYFL066C 1179 nt14.74□□□□□ -0.05
PRP45P28004 EMI2YDR516C 1503 nt14.74□□□□□ -0.05
PRP45P28004 GIS3YLR094C 1509 nt14.71□□□□□ -0.05
PRP45P28004 WSC2YNL283C 1512 nt14.71□□□□□ -0.06
PRP45P28004 YDL221WYDL221W 552 nt14.7□□□□□ -0.06
PRP45P28004 NAT4YMR069W 858 nt14.69□□□□□ -0.06
PRP45P28004 AHT1YHR093W 549 nt14.67□□□□□ -0.06
PRP45P28004 YIL100WYIL100W 354 nt14.67□□□□□ -0.06
PRP45P28004 PCM1YEL058W 1674 nt14.66□□□□□ -0.06
PRP45P28004 PEX25YPL112C 1185 nt14.65□□□□□ -0.06
PRP45P28004 RNQ1YCL028W 1218 nt14.63□□□□□ -0.07
PRP45P28004 YIH1YCR059C 777 nt14.57□□□□□ -0.08
PRP45P28004 GLK1YCL040W 1503 nt14.55□□□□□ -0.08
PRP45P28004 YMR090WYMR090W 684 nt14.54□□□□□ -0.08
PRP45P28004 YSP3YOR003W 1437 nt14.52□□□□□ -0.08
PRP45P28004 MSF1YPR047W 1410 nt14.51□□□□□ -0.09
PRP45P28004 YNL115CYNL115C 1935 nt14.51□□□□□ -0.09
PRP45P28004 BDH1YAL060W 1149 nt14.49□□□□□ -0.09
PRP45P28004 YMR244WYMR244W 1068 nt14.49□□□□□ -0.09
PRP45P28004 SCC4YER147C 1875 nt14.42□□□□□ -0.1
PRP45P28004 THI74YDR438W 1113 nt14.42□□□□□ -0.1
PRP45P28004 MIR1YJR077C 936 nt14.41□□□□□ -0.1
PRP45P28004 YSC84YHR016C 1407 nt14.41□□□□□ -0.1
PRP45P28004 YLL053CYLL053C 459 nt14.39□□□□□ -0.11
PRP45P28004 YLR415CYLR415C 339 nt14.39□□□□□ -0.11
PRP45P28004 AQY1YPR192W 918 nt14.39□□□□□ -0.11
PRP45P28004 SDH1YKL148C 1923 nt14.38□□□□□ -0.11
PRP45P28004 FTR1YER145C 1215 nt14.35□□□□□ -0.11
PRP45P28004 GAL1YBR020W 1587 nt14.32□□□□□ -0.12
PRP45P28004 GLR1YPL091W 1452 nt14.29□□□□□ -0.12
PRP45P28004 BIO4YNR057C 714 nt14.28□□□□□ -0.12
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