Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
LINC00312Q9Y6C7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms