Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNX8Q9Y5X2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms