Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SHANK2Q9UPX8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SHANK2Q9UPX8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms