Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SATB2Q9UPW6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms