Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX7Q9UNH6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms