Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RIMKLBQ9ULI2 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMKLBQ9ULI2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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