Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAPPC2LQ9UL33 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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