Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APEX2Q9UBZ4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms