Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CPNE7Q9UBL6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CPNE7Q9UBL6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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