Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG3Q9NT62 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG3Q9NT62 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms