Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HMG20AQ9NP66 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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