Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BPIFA1Q9NP55 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms