Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C11orf49Q9H6J7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms