Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms