Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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