Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RSPO3Q9BXY4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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