Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SYCP2Q9BX26 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYCP2Q9BX26 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms