Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS5

TRMT61B, tRNA (adenine(58)-N(1))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT61BQ9BVS5 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TRMT61BQ9BVS5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms