Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TREX2Q9BQ50 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms