Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
C2orf48Q96LS8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms