Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LTV1Q96GA3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms