Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SIRT1Q96EB6 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SIRT1Q96EB6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms