Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C18orf8Q96DM3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C18orf8Q96DM3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms