Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MCOLN3Q8TDD5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms