Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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TMIEQ8NEW7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIEQ8NEW7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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