Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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ZNF548Q8NEK5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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ZNF548Q8NEK5 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF548Q8NEK5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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