Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FAM71DQ8N9W8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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