Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AMER3Q8N944 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMER3Q8N944 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms