Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C10orf53Q8N6V4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms