Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCSAMQ8N6F7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms