Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SVOPQ8N4V2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms