Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CLIP4Q8N3C7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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CLIP4Q8N3C7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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CLIP4Q8N3C7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
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CLIP4Q8N3C7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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CLIP4Q8N3C7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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CLIP4Q8N3C7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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