Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
C9orf40Q8IXQ3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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C9orf40Q8IXQ3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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