Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC8-201ENST00000321424 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PCSK1-202ENST00000508626 2234 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CYP27C1-202ENST00000409327 2092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms