Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PAN2Q504Q3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms