Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYTL3Q4VX76 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms