Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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FAM187BQ17R55 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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FAM187BQ17R55 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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FAM187BQ17R55 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM187BQ17R55 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM187BQ17R55 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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