Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DDR2Q16832 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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