Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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E2F4Q16254 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E2F4Q16254 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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