Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC1A5Q15758 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC1A5Q15758 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms