Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TLR1Q15399 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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