Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SCARF1Q14162 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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SCARF1Q14162 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SCARF1Q14162 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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