Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1SQ13698 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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